Question

Почему большая часть мутаций не проявляется внешне

Answer 1

Есть два вида: фенотипная(внешняя) и геномная(внутренняя)
фенотипные мутации проявляются тоже достаточно часто, но в следствии воздействия очень жестких факторов или причин (радиация (но, при радиации, мутация проявляется только в следующих поколениях))
геномные мутации проявляются чаще, ибо на геном повлиять легче, чем на внешние особенности. (пример: перенесенные заболевания, наследственность, отклонения в хромосомном наборе и т.д)
просто причин геномной мутации намного больше, чем фенотипной