Question

Практична робота № 1 Розв'язування елементарних вправ зі структури білків і нуклеїнових кислотМета: навчитися застосовувати знання про будову білків і нуклеїнових кислот для розв'язування вправ.Довідкова інформація: лінійна довжина одного амінокислотного залишку: (ак) = 0,35 нм; середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного за- лишку: М(ак) = 110; лінійна довжина одного нуклеотида: 1(нк) = 0,34 нм; середня відносна молекулярна маса одного нуклеотида: М,(нк) = 345.Хід роботиВправи та задачі про структуру білка1 2 Відносна молекулярна маса білка м'язів міозину близько 500 000. Скільки амінокислотних залишків входить до складу його ланцюга?Білок пепсин містить 340 амінокислотних залишків. Визначте масу й довжи ну білкового ланцюга цього ферменту.Напишіть усі можливі послідовності амінокислотних ланцюгів довжиною у два залишки, що складаються з різних або однакових амінокислот <<А>>> 1 «Б», та підрахуйте їх кількість. Зробіть те саме з набором амінокислот <<<А>>, <<Б>> і <<В>>. Виведіть загальну формулу для визначення кількості ва- ріантів амінокислотних ланцюгів залежно від їхньої довжини (кількості за- лишків) та різноманітності амінокислот у їхньому складі.Гормон росту соматотропін містить 9 залишків амінокислоти лізину з від- носною молекулярною масою 146. Яку відносну молекулярну масу має весь білок, якщо лізин становить всього 5,29% від його маси?5 Яка кількість пептидних зв'язків у молекулі білка, що складається зі 191 амі- нокислотного залишку?​

Answer 1

Ответ:

Давайте розглянемо вправи зі структури білків:

1. Для обчислення кількості амінокислотних залишків в міозині, вам потрібно поділити відносну молекулярну масу білка на середню відносну молекулярну масу одного амінокислотного залишку:

Кількість залишків = (Відносна молекулярна маса білка) / (Середня відносна молекулярна маса амінокислотного залишку)

Кількість залишків = 500,000 / 110 = 4545 амінокислотних залишків.

2. Для обчислення маси і довжини білкового ланцюга пепсину, використовуйте дані про кількість амінокислотних залишків:

Маса білкового ланцюга = (Кількість амінокислотних залишків) × (Середня відносна молекулярна маса амінокислотного залишку)

Маса білкового ланцюга = 340 × 110 = 37,400 а.о.м. (атомних одиниць маси)

Довжина білкового ланцюга = (Кількість амінокислотних залишків) × (Довжина одного амінокислотного залишку)

Довжина білкового ланцюга = 340 × 0,35 нм = 119 нм.

3. Для знаходження кількості можливих послідовностей амінокислотних ланцюгів, вам потрібно враховувати кількість можливих амінокислот і довжину ланцюга. З формули можна знайти кількість варіантів:

Кількість варіантів = (Кількість амінокислот) ^ (Довжина ланцюга)

4. Для обчислення відносної молекулярної маси білка, враховуючи вміст лізину, спершу знайдемо масу лізину в білку, а потім додамо її до маси інших залишків:

Маса лізину = (Відсоток лізину від загальної маси білка) × (Відносна молекулярна маса лізину)

Маса лізину = (5,29% / 100) × 146 = 7,71 а.о.м.

Відносна молекулярна маса білка = (Відсоток лізину від загальної маси білка + Відносна молекулярна маса інших залишків) / (Відсоток лізину від загальної маси білка) = (100% / (100% - 5,29%)) × (500,000 + Маса лізину)

Відносна молекулярна маса білка ≈ (100% / 94,71%) × (500,000 + 7,71) ≈ 528,418 а.о.м.

5. Для знаходження кількості пептидних зв'язків у білку, вам потрібно помножити кількість амінокислотних залишків на 2, оскільки кожен пептидний зв'язок формується між двома амінокислотними залишками:

Кількість пептидних зв'язків = (Кількість амінокислотних залишків) × 2 = 191 × 2 = 382 пептидних зв'язків.

Сподіваюся, це допоможе вам розв'язати вправи зі структури білків.

Answer 2

1. Для розв'язання першої задачі потрібно визначити кількість амінокислотних залишків у білку міозину. Для цього використовуємо формулу: Кількість амінокислотних залишків = Відносна молекулярна маса білка / Середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного залишку Отже, кількість амінокислотних залишків = 500 000 / 110 ≈ 4545

2. Для розв'язання другої задачі потрібно визначити масу та довжину білкового ланцюга ферменту пепсину. Для цього використовуємо формули: Маса білкового ланцюга = Кількість амінокислотних залишків * Середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного залишку Маса білкового ланцюга = 340 * 110 = 37 400 Довжина білкового ланцюга = Кількість амінокислотних залишків * Лінійна довжина одного амінокислотного залишку Довжина білкового ланцюга = 340 * 0,35 = 119 нм

3. Для розв'язання третьої задачі потрібно знайти всі можливі послідовності амінокислотних ланцюгів довжиною у два залишки та підрахувати їх кількість. Також потрібно знайти загальну формулу для визначення кількості варіантів амінокислотних ланцюгів залежно від їхньої довжини та різноманітності амінокислот у їхньому складі.

4. Для розв'язання четвертої задачі потрібно знайти відносну молекулярну масу всього білка за відомою масою одного амінокислотного залишку, його кількістю та вмістом лізину у білку.

5. Для розв'язання п'ятої задачі потрібно визначити кількість пептидних зв'язків у молекулі білка, використовуючи формулу: Кількість пептидних зв'язків = Кількість амінокислотних залишків - 1 Отже, кількість пептидних зв'язків = 191 - 1 = 190.

Answer 3

1. Для розв'язання першої вправи, потрібно визначити кількість амінокислотних залишків в складі білка міозину. Для цього використовуємо формулу: кількість амінокислотних залишків = відносна молекулярна маса білка / середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного залишку. Отже, кількість амінокислотних залишків = 500,000 / 110 = 4545 амінокислотних залишків.

2. Для розв'язання другої вправи, потрібно визначити масу та довжину білкового ланцюга ферменту пепсину. Для цього використовуємо формулу: маса білкового ланцюга = кількість амінокислотних залишків * середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного залишку. Отже, маса білкового ланцюга пепсину = 340 * 110 = 37,400.

3. Для розв'язання третьої вправи, потрібно визначити всі можливі послідовності амінокислотних ланцюгів довжиною у два залишки. Для цього використовуємо поєднання амінокислот, що мають довжину у два залишки. Наприклад, для послідовності "А" та "Б" буде можливо 20 комбінацій, а для "А", "Б" та "В" - 800 комбінацій. Загальна формула для визначення кількості варіантів амінокислотних ланцюгів залежить від їхньої довжини та різноманітності амінокислот у їхньому складі.

4. Для розв'язання четвертої вправи, потрібно визначити відносну молекулярну масу білка гормону росту соматотропіну. Для цього використовуємо формулу: відносна молекулярна маса білка = (відносна молекулярна маса амінокислоти * кількість амінокислоти) / вміст лізину у білку. Отже, відносна молекулярна маса білка = (146 * 9) / 0.0529 = 261,167.

5. Для розв'язання п'ятої вправи, потрібно визначити кількість пептидних зв'язків у молекулі білка. Для цього використовуємо формулу: кількість пептидних зв'язків = кількість амінокислотних залишків - 1. Отже, кількість пептидних зв'язків = 191 - 1 = 190.