Question

3.выделяют четыре уровня организации белковой молекулы.связи в молекуле белка , принимающие участие в образовании вторичной структуры ? ​

Answer 1

Связи, которые принимают участие в образовании вторичной структуры белка, включают гидрофобные взаимодействия, водородные связи и взаимодействия польностью-дипольности. Гидрофобные взаимодействия происходят между гидрофобными (неполярными) аминокислотными остатками, когда они сближаются в результате сворачивания белковой цепи. Водородные связи образуются между положительно заряженными водородными атомами одних аминокислотных остатков и отрицательно заряженными атомами кислорода, азота или серы других остатков. Взаимодействия польностью-дипольности возникают между полярными остатками, имеющими заряд или дипольный момент. Все эти связи способствуют формированию стабильной структуры белка.

Answer 2

Вторичная структура белковой молекулы определяется пространственным расположением аминокислотных остатков. В основе образования вторичной структуры лежат связи водорода, которые образуются между атомами аминокислотных остатков.

Наиболее распространенными типами связей водородной связи, которые принимают участие в формировании вторичной структуры белков, являются:

1. Антипараллельная бета-складка (бета-лист): На каждую аминокислоту в цепи протягивается два атома кислорода, которые образуют две связи водорода со соседними аминокислотами. Определенная последовательность взаимодействия связей водорода позволяет аминокислотным остаткам формировать антипараллельное пространственное расположение.

2. Параллельная бета-складка: Здесь атомы кислорода, которые образуют связи водорода, находятся на одной стороне цепи аминокислотных остатков. В результате, цепи аминокислотных остатков имеют одинаковое направление, и их участки связываются параллельно друг другу.

3. Альфа-виток: Это пространственное образование, которое вызвано связями водорода между аминокислотными остатками в пределах одной цепи. В этом случае, связь водорода формируется между аминогруппой одной аминокислоты и карбоксильной группой другой аминокислоты, образуя спиральную структуру.

4. Зацеп: Это тип вторичной структуры, который образуется в следствие связей водорода между разными частями цепи белка. В результате, молекула белка может принимать форму петли или вилки.

Все эти связи водорода вместе способствуют формированию вторичной структуры белковой молекулы и могут быть важными для ее функционирования.